Découverte d’un important microbe qui vit dans la coquille des bivalves et les aide à rester en bonne santé

Crassostrea virginica (crédit : Andrew C, CC BY 2.0, Wikimedia Commons)

Les invertébrés tels que les coraux, les éponges et les huîtres dépendent également d’un microbiome très actif. Et c’est précisément le microbiome de certaines de ces créatures marines qui a fait l’objet d’une nouvelle étude menée par des scientifiques de l’université de Rhode Island.
Ying Zhang, professeur associé de biologie cellulaire et moléculaire et l’un des principaux auteurs de l’étude, admet que la science en sait encore très peu aujourd’hui sur les groupes de microbes qui vivent dans les mollusques bivalves. On ne sait même pas, par exemple, si ces microbiomes en général aident l’animal ou lui nuisent d’une quelconque manière.

Zhang, ainsi que Zachary Pimentel, étudiant en doctorat, ont donc effectué diverses analyses de l’ADN de certains microbes trouvés à l’intérieur ou à l’extérieur, c’est-à-dire sur la coquille extérieure, d’une espèce d’huître appelée Crassostrea virginica, également appelée huître orientale I huître américaine. Les bactéries vivent à l’intérieur de la coquille, entre les branchies et dans presque toutes les crevasses de la structure anatomique de ces animaux. Ils ont ensuite reconstruit le génome de ces groupes les plus abondants. Ils ont notamment identifié une bactérie de la classe des Mollicutes qui semble obtenir l’énergie dont elle a besoin en consommant de la chitine, un composant important de l’anatomie de ces invertébrés.

Les chercheurs ont constaté que cette bactérie était plus abondante dans la zone intestinale des bivalves testés, ce qui semble être un indicateur d’un être sain. Cependant, lorsqu’ils l’ont trouvée dans d’autres tissus différents, cette bactérie est devenue un indicateur d’infection.
“Lorsqu’ils sont abondants dans l’intestin d’huîtres saines, cela pourrait indiquer que les huîtres sont heureuses de les avoir”, explique Zhang. “Mais lorsque le microbe devient abondant dans d’autres tissus, cela peut être le signe que l’huître ne va pas bien, peut-être parce que le système immunitaire est devenu fou.”[1]

En outre, ce microbe semble également consommer de l’arginine, un acide aminé présent dans de très nombreux organismes et utilisé pour la production de protéines. Cette substance est importante car elle permet aux bivalves de déclencher des réponses immunitaires contre les infections. Ces microbes sont donc importants pour l’immunité des bivalves.
En outre, ces microbes semblent être très rares dans la phase larvaire des bivalves et très abondants dans la phase adulte. Cela signifie, comme l’explique Zhang lui-même, que ces microbes très importants sont acquis pendant la croissance. Il ne reste plus qu’à découvrir à quel moment ces bactéries sont acquises par les bivalves, une information qui pourrait s’avérer importante pour préserver les populations de plusieurs espèces actuellement menacées.

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Maxime Le Moine
Maxime Le Moine
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